1. 產品性能方面
無血清培養基更好。血清并不是生來就為養細胞而來的。血清是全血的一部分，組分很雜亂，有150多種已知組分組分，多種不知道組分。這些組分中，有些對細胞成長是有利的，有些對細胞成長是無效果的，有些對細胞成長反而是有害的。
而無血清培養基，絕大多數都是面向某一種細胞而設計的。產品設計是根據對該細胞的知道去獨自設計的配方，僅增加有正面效果的組分，不會去增加效果不明或有害的物質（沒來由的增加本錢的事情很難發作）。所以，無血清培養基的性能從根子上講要好于血清培養基，并且會跟著人們對該細胞知道程度的增進而進一步提升。
2. 產品安全性方面
這個就十分明顯了。無血清培養基，其配方的各種物質都是明確的。沒有任何不知道的組分。假如全部挑選非動物來歷的組分，那么從根子上就不會有含有任何不知道的蛋白組分。安全性是明確的。
3. 產品價格方面
一般來說，價格是無血清培養基zui大的劣勢。但就目前來看的確也不能一概而論。事實上，現已大規模工業化應用的無血清培養基，其價格現已跟血清培養基適當，有的乃至低于血清培養基。當然，對與某些用處的無血清培養基，價格的確十分昂貴。中心原因也在于增加的重組蛋白種類較、產量極低、難以商業化大規模生產，造成了生產本錢的居高不下。
4. 使用隨意性方面
一般來說，血清培養基要強一些。使用隨意性，一般是指接種密度、細胞消化方式、細胞培養瓶的挑選、大規模培養時的反應器轉速等方面。
由于無血清培養基是專門設計用于大規模細胞培養的。而大規模培養的客戶對價格都是十分敏感的。因此，無血清培養基在設計之初就在本錢與使用隨意性之間取得了平衡。無血清培養基更適合在確認條件下使用。血清培養基由于血清中有各種蛋白，對操作誤差的容錯性更好，所以對操作人員的要求相對就更少一些。
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